Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS4AQ9UN37 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms