Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PLXNB3Q9ULL4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms