Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2IRD1Q9UHL9 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms