Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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COPS7AQ9UBW8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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COPS7AQ9UBW8 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
COPS7AQ9UBW8 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
COPS7AQ9UBW8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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