Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms