Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
THUMPD1Q9NXG2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
THUMPD1Q9NXG2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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