Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX15Q9NRS6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms