Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPAG4Q9NPE6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPAG4Q9NPE6 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms