Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CIPCQ9C0C6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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