Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM5Q9C035 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms