Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NLRP1Q9C000 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms