Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms