Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM55Q9BYV6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms