Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms