Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NICN1Q9BSH3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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