Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
EBF4Q9BQW3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EBF4Q9BQW3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1030.4 ms