Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LPIN3Q9BQK8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LPIN3Q9BQK8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms