Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNS3Q9BQ31 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms