Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMAD5Q99717 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMAD5Q99717 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD5Q99717 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms