Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IFT140Q96RY7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms