Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
C9orf85Q96MD7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms