Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SHDQ96IW2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SHDQ96IW2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms