Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC97Q96F63 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms