Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SGF29Q96ES7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SGF29Q96ES7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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SGF29Q96ES7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGF29Q96ES7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms