Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C17orf47Q8NEP4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C17orf47Q8NEP4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms