Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG16L2Q8NAA4 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG16L2Q8NAA4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG16L2Q8NAA4 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG16L2Q8NAA4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG16L2Q8NAA4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG16L2Q8NAA4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG16L2Q8NAA4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG16L2Q8NAA4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG16L2Q8NAA4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG16L2Q8NAA4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG16L2Q8NAA4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG16L2Q8NAA4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG16L2Q8NAA4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG16L2Q8NAA4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG16L2Q8NAA4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG16L2Q8NAA4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG16L2Q8NAA4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG16L2Q8NAA4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG16L2Q8NAA4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG16L2Q8NAA4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG16L2Q8NAA4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG16L2Q8NAA4 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG16L2Q8NAA4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG16L2Q8NAA4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG16L2Q8NAA4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms