Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
STRCQ7RTU9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRCQ7RTU9 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms