Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GDF6Q6KF10 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GDF6Q6KF10 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms