Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR3

TYW3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYW3Q6IPR3 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TYW3Q6IPR3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TYW3Q6IPR3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms