Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATG16L1Q676U5 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms