Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FAM208BQ5VWN6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms