Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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