Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LDLRAP1Q5SW96 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms