Protein–RNA interactions for Protein: Q30KQ1

DEFB133, Beta-defensin 133, humanhuman

Predictions only

Length 61 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB133Q30KQ1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DEFB133Q30KQ1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms