Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms