Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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