Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NDUFA9Q16795 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms