Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SLC18A3Q16572 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC18A3Q16572 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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