Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS72Q15906 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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