Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CHRNA6Q15825 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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