Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TAF1AQ15573 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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