Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 MED25-209ENST00000612791 881 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC114488.2-208ENST00000591592 578 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC241585.2-202ENST00000621798 1015 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 C12orf45-205ENST00000622317 1078 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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