Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TLR1Q15399 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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