Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TNIP1Q15025 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms