Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HNF4GQ14541 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HNF4GQ14541 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HNF4GQ14541 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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HNF4GQ14541 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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HNF4GQ14541 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HNF4GQ14541 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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