Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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CUL4AQ13619 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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CUL4AQ13619 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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CUL4AQ13619 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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CUL4AQ13619 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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CUL4AQ13619 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CUL4AQ13619 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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