Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEUROD1Q13562 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEUROD1Q13562 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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