Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BPTFQ12830 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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