Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CGNL1Q0VF96 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGNL1Q0VF96 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms