Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GOLGA3Q08378 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA3Q08378 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA3Q08378 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA3Q08378 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA3Q08378 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA3Q08378 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA3Q08378 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA3Q08378 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA3Q08378 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA3Q08378 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA3Q08378 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA3Q08378 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA3Q08378 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GOLGA3Q08378 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA3Q08378 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA3Q08378 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA3Q08378 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA3Q08378 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA3Q08378 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA3Q08378 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA3Q08378 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA3Q08378 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA3Q08378 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA3Q08378 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms